A medence tisztaságának megőrzése kulcsfontosságú a betegségek terjedésének megelőzésében, a balesetek elkerülésében és a fertőzések megelőzésében. Ajánlott legalább hetente egyszer elvégezni a medence átfogó tisztítását, különösen a gyakori használat időszakában. A rendszeres tisztítás nem csak a szűrőgolyók mosását jelenti, hanem a víz minőségének ellenőrzését, a medence falainak és padlójának, valamint egyéb berendezések, például szivattyúk és szűrőrendszerek tisztítását is.